En el 2000, a Marvel se le metió una idea salvaje para comenzar una nueva carrera con algunas promesas jóvenes de la escritura junto con algunos artistas establecidos. Por supuesto, eso resultó en el Universo Ultimate con títulos como ULTIMATE SPIDER-MAN corrieron a cargo de un par de tipos llamados Brian Michael Bendis y Mark Bagley. La serie funcionó por años con el mismo equipo creativo.
Bendis y Bagley iniciaron con un arco de siete números (que puedes encontrar editado por Marvel Comics México) sobre el origen de Spider-Man que realmente sumó y desarrolló muchos detalles al mismo tiempo que actualizó el trasfondo y agregó nuevas tramas. Por ejemplo, la araña que mordió a Peter provino realmente de uno de los laboratorios de Norman Osborn. En un esfuerzo por reproducir los resultados encontrados en Parker, Osborn se inyectó con una mezcla similar que lo convirtió en Green Goblin.
Después de enfrentarse al Duende por primera vez, Peter se contrató en “The Daily Bugle” y pronto se enteró de un mafioso apodado Kingpin. Él entonces se convirtió en el criminal a perseguir así como sus matones, los Enforcers, y Electro.
En un cambio importante alejado de la tradición, esta versión de Parker reveló a Mary Jane su identidad secreta como Spider-Man. Comprensiblemente escéptica, Mary Jane se rió al principio y lo negó. Así que Peter hizo lo único que pudo: saltó a la pared, luego se pegó al techo. Primero le explicó de dónde vinieron los poderes, luego le dijo que mostrar su telaraña sería demasiado peligroso y finalmente le pidió nunca decirle a nadie.
También respondió a otra pregunta importante: por qué él le contó todo esto, aunque sabía que podía ser peligroso: “Porque he estado lastimando tus sentimientos últimamente debido a esto. Siempre huyendo o no estando donde digo que voy a estar y, y tú mereces algo mejor que eso”.
Mary Jane entonces admitió haber pensado que él la llevó a su habitación para un primer beso, que parecía una buena idea hasta que la tía May interrumpió con la mamá de Mary Jane en el teléfono. Incluso con cantidades importantes de mortificación corriendo a través de él, Peter todavía se sentía lo bastante feliz para disfrutar el momento.
La relación de Peter y Mary Jane pasó por muchos cambios durante el resto de su vida, pues se separaron y volvieron a reunirse varias veces. Ella lo lloró cuando él, aparentemente, murió, pero los dos se reunieron después de que él regresó y se fue a recorrer el país mientras Miles Morales continuó como Spider-Man.
